L'utilisation excessive des antibiotiques par l'élevage intensif a provoqué l'apparition de bactéries dangereuses pour la santé et multirésistantes.
Un chercheur néerlandais a, le premier, tiré la sonnette d'alarme en 2004 après avoir identifié la présence du SARM (staphylocoque doré résistant à la méthicilline) dans des élevages porcins. Sur le banc des accusés : l'administration massive d'antibiotiques aux animaux. Comme les Pays-Bas et le Danemark, l'Allemagne et la France sont touchées par l'explosion des infections difficiles à soigner, car résistantes à ces médicaments. Les volailles produites à la chaîne suscitent aussi la méfiance : sont-elles infestées d'entérobactéries tout aussi coriaces ? En outre, en dehors du contact direct avec le bétail, les bactéries se propagent via les cheminées d'aération des bâtiments d'élevage ou les épandages de fumier dans les champs, ce qui peut contaminer d'autres cultures, qu'elles soient bio ou pas.