Alors que Chloe tente de rendre le centre de contrôle opérationnel, Jake et Cole se rendent sur les docks où ils sont attendus par les hommes de Samir.
La cellule anti-terroriste de New York est dévastée après l'explosion de la bombe électromagnétique, et tous les systèmes de communication sont détruits. Chloe est obligée de prendre des mesures drastiques pour tenter de rendre à nouveau opérationnel le centre de contrôle. Pendant ce temps, Jake, Cole et deux agents suivent une piste qui mène vers les docks. Mais les hommes de Samir leur tendent une embuscade. Pendant qu'une équipe de spécialistes de la ville de New York, dirigée par l'agent Haynam, arrive à la CAT pour réparer le système de l'agence, Chloe, inquiète pour Jack, appelle Renee à la rescousse...