Vaughn et Sydney se rendent à Mexico pour mettre la main sur une carte menant à la boîte de Rambaldi, qui pourrait renfermer une terrible arme biologique.
La boîte de Rambaldi intrigue toujours la CIA. Tout le monde ignore où se trouve la clé nécessaire à son ouverture, mais Sydney et Vaughn retrouvent sa trace lors d'un voyage au Mexique. Ils apprennent que Kazari Bomani, un membre important de la pègre, proche du Covenant, possède une carte menant à cette clé et que la boîte de Rambaldi contient une arme biologique terrifiante, capable de tuer des millions de personnes. D'autre part, Vaughn, lors d'un dîner au restaurant, annonce à Lauren qu'il souhaite la quitter. Folle de rage, celle-ci quitte la table et entre en contact avec Sark...