William Shatner pose des questions qui suscitent la réflexion des principaux experts de l'émission autour de la théorie des anciens astronautes.
Alien Theory examine 75 millions d'années de preuves extraterrestres les plus crédibles sur Terre, de l'âge des dinosaures à l'Égypte ancienne, en passant par le ciel du désert occidental des États-Unis actuels. D'anciennes peintures rupestres représentant d'étranges créatures, une substance ressemblant à de l'asphalte dans une pyramide égyptienne faite de restes de créatures non identifiées, des observations massives continues aux États-Unis : ce ne sont là que quelques-unes des histoires étranges qui seront examinées.