Au Japon, un ancien étudiant devenu terroriste sème la terreur dans tout le pays. Pour le contrer, les autorités enrôlent de force 42 lycéens.
Trois ans ont passé depuis la première expérience de Battle Royale. Shuya Nanahara, l'un des deux survivants du programme, est devenu un terroriste d'envergure internationale au sein de l'organisation Wild Seven. Pour mettre fin à ses agissements, le gouvernement crée le programme Battle Royale II...