Eddie et Beethoven, renvoyés d'Hollywood, rencontrent sur leur chemin une mère et son petit garçon, en quête du trésor d'un pirate, fondateur de leur ville.
Le chien Beethoven et son maître Eddie sont renvoyés d'Hollywood car Beethoven, déprimé, n'obéit plus sur le tournage du film dont il a le premier rôle. Alors qu'ils rentrent en voiture, ils tombent en panne à O'Malley's Cove, petite ville au bord de la faillite, fondée par un pirate. Eddie et Beethoven sympathisent avec le petit Sam et sa maman Anne. Le papa est mort et Sam continue sans lui leur quête du trésor du pirate O'Malley...
Une comédie familiale avec en vedette le Saint-Bernard préféré de l'Amérique.