Pendant que l'équipage de Flint affronte une tempête, l'ancien capitaine de Vane renverse les alliances à Nassau, menacée par l'arrivée d'une flotte royale.
Une flotte royale fait route vers Nassau, avec à son bord Eleanor. La jeune femme tente de faire comprendre à Rogers qu'elle est indispensable à la réussite de son opération. De son côté, le capitaine Flint affronte une terrible tempête pour échapper au capitaine Hornigold. Il souffre d'hallucinations, qui lui montrent Miranda sous la forme d'un spectre. John Silver, qui souffre depuis son amputation, aide comme il le peut les pirates à colmater les brèches dans la coque du navire. A Nassau, l'ancien capitaine de Charles Vane refait surface et renverse les alliances...