Rodrigo est ravi que Lucrezia ait quitté le couvent. Cesare cherche des preuves pour dénoncer Juan. Lorsque celui-ci disparaît, Cesare veut le retrouver.
Goffredo vient à Rome avec sa femme Sancia, enceinte. Rodrigo est ravi d'apprendre que Lucrezia a finalement renoncé à devenir nonne, mais Giulia fait triste mine, craignant que sa fille n'ait pas droit au même intérêt de la part de son père. Depuis qu'il a découvert le secret de Juan, Cesare cherche les preuves pour pouvoir le dénoncer. Lorsque son frère disparaît après une nuit houleuse chez les Borgia, Cesare met tout en oeuvre pour le retrouver...