Tandis que Jimmy Figgis court toujours, Jake et le capitaine Holt sont exilés en Floride, où ils bénéficient du programme de protection des témoins.
Jake et le capitaine Holt, exilés en Floride et placés sous le programme de protection des témoins, tentent de s'accoutumer à leur nouvelle existence. Jimmy Figgis, alias «le Boucher», qui veut la mort d'Adrian Pimento, est toujours en liberté. Karen Haas, US Marshall, est désormais leur seul lien avec le Brooklyn 9-9. Jake cherche à s'intégrer dans sa nouvelle équipe. Mais l'anonymat du duo sous couverture est bientôt menacé...