Les jésuites survivent au chaos de la guerre civile chinoise du XVIIe siècle. Mais en 1665, l'un d'eux Johann Adam Schall von Bell, est condamné à mort pour prosélytisme.
Après la mort en 1610 de Matteo Ricci, un autre membre de la Compagnie de Jésus, l'Allemand Johann Adam Schall von Bell, poursuit la rédaction d'un nouveau calendrier selon le mode occidental. Mais la guerre civile et le suicide de l'empereur Chongzhen, dernier de la dynastie Ming, plongent l'empire chinois dans le chaos. L'arrivée des Mandchous, en 1644, met fin au désordre. Nommé par le régent à la tête du Bureau astronomique impérial, Schall von Bell devient également le précepteur du premier empereur de la nouvelle dynastie Qing, le jeune Shunzhi. Mais sa gestion du Bureau astronomique et son prosélytisme suscitent de plus en plus de critiques au sein de la Cité interdite. Accusé d'avoir voulu imposer ses théories et sa religion, il est emprisonné. En 1665, il est condamné à mort.