A la suite d'une tentative malheureuse de Jérémie pour faire apparaître Aelita, le programme qui gère la jeune fille virtuelle se bloque.
A la suite d'une tentative malheureuse de Jérémie pour faire apparaître Aelita, le programme qui gère la jeune fille virtuelle se bloque : si celle-ci désactive une tour, elle disparaît purement et simplement de Lyoko. Une course contre la montre commence pour Jérémie, qui doit absolument réparer le programme d'Aelita avant la prochaine attaque de Xana...