Projeté une nouvelle fois dans l'espace-temps, Sam Beckett revêt l'identité d'un prêtre dans le but de sauver la vie d'un homme d'Eglise témoin d'un meurtre.
En devenant Frank Pistano, un jeune prêtre de l'église Saint-Dorothy, Sam doit empêcher le meurtre imminent de son supérieur. La vie du père John McRoberts, témoin d'une agression mortelle, est en effet menacée...