Tandis que Jacob Clarke se rend au chevet de sa mère mourante, Eric Crawford, accompagné du docteur Chet Wakeman, poursuit les recherches de son père.
1980. Après vingt ans d'absence, Jacob Clarke retourne auprès de sa mère mourante pour lui faire ses adieux. C'est l'occasion pour lui de partager enfin son secret avec son frère Tom. Quant à Eric Crawford, il poursuit les investigations secrètes que son père avait entreprises pour le compte du gouvernement. Le docteur Chet Wakeman se joint à lui et les deux hommes tentent de retrouver Jacob et Jesse Keys, espérant qu'ils pourront leur fournir de nouvelles informations au sujet des enlèvements extraterrestres. Mais leurs recherches génèrent un conflit entre les victimes, les militaires et quelques visiteurs inattendus...