Jacob Hood est appelé à Philadelphie, où se répand une maladie contagieuse. Il y retrouve un vieil ami, qui va l'aider à trouver un traitement contre le virus.
Un ouvrier du bâtiment trouve un homme mourant dans un réseau de catacombes. Alors qu'il est en réunion avec Rachel, le docteur Hood est prévenu qu'un nouveau cas s'est déclaré. Il apprend que le malade a craché du sang avant de mourir. Ces symptômes peuvent être ceux de nombreux virus, de la variole à Ebola. Jacob se rend en Pennsylvanie pour étudier ce cas. Il y retrouve son vieil ami Cal Rigdon. Ensemble, ils se rendent dans les catacombes où le malade a trouvé la mort. Le cadavre est toujours sur les lieux. Selon Jacob, il a succombé à la variole. Ce diagnostic est extrêmement inquiétant...