Une petite tortue est persuadée que, pour sauver sa grand-mère tombée malade, il lui faut à tout prix retrouver une mystérieuse "boîte à souvenirs".
A la fin des vacances, Franklin a la surprise de voir arriver sa tante Lucie accompagnée de sa filleule, Samantha. Mais sa joie est de courte durée parce que Sam se montre odieuse. Leurs parents les obligent à faire la paix, ce que Franklin accepte à contre-coeur. Le lendemain, ils vont tous deux rendre visite à leur grand-mère. Celle-ci leur raconte son enfance, la mort de ses parents et comment elle a enterré une boîte à souvenirs. Le soir même, elle tombe malade. Pour la guérir, Franklin se met en tête de retrouver la mystérieuse boîte. Ses amis et même tante Lucie lui promettent de l'aider. Une longue et périlleuse aventure commence...
Franklin passe allègrement du petit au grand écran pour la grande joie de ses très jeunes fans.