Le commandant Sadone est envoyé sur Terre. Alcor échoue à arrêter un missile ennemi qui détruit une maison et blesse ses habitants. Il se sent bientôt rongé par la culpabilité...
Goldorak essaie de venir en aide à Alcor, kidnappé et retenu prisonnier dans la base sous-marine d'Horos, mais celle-ci se situe à une telle profondeur qu'il ne peut pas l'atteindre. Le Professeur Procyon met au point l'Aquarak afin d'accéder à la base ennemie...