Désormais fugitifs, John-117 et Kwan cherchent refuge dans une base secrète. Sur Reach, Halsey examine en détail les dernières actions de John-117.
John-117 et Kwan, maintenant fugitifs, trouvent refuge sur Rubble, une base des insurgés construite sur des astéroïdes. Ils y retrouvent Soren, un ami de John, lui aussi déserteur. Sur Reach, Catherine Halsey étudie les dernières actions de John, cherchant à comprendre ce qui l'a poussé à agir comme il l'a fait. L'amiral Keyes envoie une équipe à la recherche de John. Au même moment, sur High Charity, un survivant des assaillants de Madrigal informe le Covenant que la relique a été activée.