Les policiers de Hawaii collaborent avec des agents du NCIS pour tenter d'arrêter un suspect, qui risque de répandre la variole dans la population.
Un homme, ancien militaire, est retrouvé mort d'une forme rare de la variole. Pour mener cette délicate enquête, le gouverneur demande à Danny et Chin Ho de collaborer avec G Callen et Sam Hanna, deux agents du NCIS de Los Angeles. Les policiers comprennent qu'il y a d'autres victimes, qui ont été contaminées en pensant prendre un anti-dépresseur. Ils relèvent aussi les empreintes du redoutable Dracul Comescu lors des investigations autour du défunt. Tous les indices convergent vers le même fait : Dracul Comescu, membre éminent de la mafia roumaine, serait en possession du virus et sur le point de le répandre dans toute la population de l'île...