Des terroristes prennent d'assaut la prison où se trouvent Steve et Wo Fat ; des complices ont pénétré dans le QG du 5-0 et retiennent Catherine en otage.
Wo Fat et Steve tentent de s'évader en profitant d'une attaque de l'unité de haute sécurité où ils sont retenus. Steve parvient à s'en sortir et à neutraliser Wo Fat. Pendant ce temps, le quartier général du 5-0 est également pris d'assaut par un groupe de terroristes apparemment liés aux assaillants de la prison. Ces hommes retiennent Catherine en otage. Il semblerait que ces deux affaires soient liées. Pendant ce temps, Kono et Adam sont en fuite à Hongkong depuis la mort de Michael. Ces deux derniers se retrouvent dans une situation périlleuse : quelqu'un a réussi à suivre leur trace et à les localiser...
Cette quatrième saison s'achève sur le départ de Michelle Borth, qui incarnait Catherine Rollins.