Un agent du FBI, qui enquêtait sur le crime organisé, a été tué. McGarrett cherche le coupable parmi les gangs de l'île et tente de créer une unité spéciale.
Lorsqu'un agent du FBI, qui était sur le point de démanteler un réseau du crime organisé, est tué dans l'explosion d'une bombe à son domicile, McGarrett fait le tour de tous les criminels liés aux gangs de l'île pour tenter de trouver le coupable au plus vite. McGarrett charge Adam de créer une nouvelle division à l'intérieur du 5-0 pour mettre en difficulté le crime organisé. Il découvre alors que l'agent avait chargé Tani d'enquêter secrètement sur Adam, notamment sur ses liens avec les yakuzas...