La vie de Po est bouleversée quand il renoue avec son père, longtemps disparu. Les deux pandas vont bientôt devoir affronter un terrible maître du kung-fu.
Maître Oogway est attaqué par le terrible Kai alors qu'il méditait dans le royaume des esprits. Kai, désormais tout-puissant, est capable de se rendre sur Terre. Pendant ce temps, en Chine, Po et ses amis apprennent que maître Shifu ne leur enseignera plus le kung-fu et qu'il confie cette tâche à Po...