Pendant l'Occupation de Paris par les Allemands, un réseau de résistants de diverses nationalités se constitue et commet près d'une centaine d'attentats.
A Paris, pendant l'Occupation, Missak Manouchian, ouvrier, poète et intellectuel d'origine arménienne, prend la tête d'un groupe de résistants, les FTP-MOI, essentiellement composé d'étrangers et de personnes de confession juive. Après la rafle du Vel d'Hiv', ils s'engagent dans l'action. Manouchian, d'abord réticent à tuer, transgresse son éthique au vu des circonstances. Sous son impulsion, le groupe se structure et commet près d'une centaine d'attentats au cours de l'année 1943. Les résistants sont alors traqués par les nazis et par la police française. Filatures, dénonciations, chantages, tortures : toutes les méthodes sont utilisées pour mettre fin à l'activité des membres du réseau Manouchian...
A sa sortie, ce film sur le réseau Manouchian a provoqué une vive polémique entre Robert Guédiguian et certains historiens.