Un colonel humain lance ses troupes contre les singes pour les éradiquer : César tente de sauver les siens et traque le militaire dans les montagnes enneigées.
César, chef éclairé des singes, fait de son mieux pour préserver ses troupes d'un colonel humain décidé à éradiquer les primates. Quand celui-ci s'en prend à sa famille, César est assoiffé de vengeance. Il décide de lancer la riposte, entouré de ses soutiens loyaux, le chimpanzé Rocket, son bras droit l'orang-outan Maurice et le gorille sensible Luca. Avec ses alliés, César part en mission à travers les paysages enneigés. En chemin, ils rencontrent un évadé d'un zoo du nom de "mauvais singe" et Nova, une petite fille rendue muette à cause d'un virus. Tous ensemble, ils rejoignent une base militaire abandonnée dans les montagnes, où s'est réfugié le colonel. La confrontation est inévitable...
Un épisode centré sur le personnage de César, qui comporte aussi des références à des classiques du cinéma ("Apocalypse Now") tout en assurant le spectacle.