Au XIXe siècle, une fillette orpheline est recueillie par son oncle. Elle va redonner à la famille de celui-ci le goût de la vie et de l'amour.
Mary Lennox, une Anglaise de 10 ans, perd ses parents, victimes d'un tremblement de terre. Elle est recueillie par son oncle dans un sombre manoir. Depuis la mort de sa femme, celui-ci abandonne à sa gouvernante tout le soin de la maisonnée. Mary explore l'immense domaine et découvre un jardin secret...