Un adolescent se réveille amnésique dans un labyrinthe géant où vivent cinquante garçons. Ensemble, ils vont tenter de trouver un moyen pour s'échapper.
Thomas, un adolescent, se réveille amnésique dans un étrange endroit à ciel ouvert entouré de hauts murs, et où vivent cinquante autres garçons. Comment a-t-il atterri ici ? Ce lieu mystérieux donne accès à un labyrinthe, dont les plans sont modifiés chaque nuit. L'inquiétude plane sur le camp : quiconque s'y est aventuré n'est jamais reparu et des créatures menaçantes y rôdent. Grâce à quelques bribes de mémoire qui lui reviennent à travers des rêves concernant une organisation secrète appelée W.C.K.D., et à des indices trouvés au sein du labyrinthe, Thomas s'efforce de trouver un moyen de s'échapper. Il demande l'aide à ses nouveaux coéquipiers, qui refusent obstinément de franchir les portes du labyrinthe...
Le jeune héros du film est interprété par Dylan O'Brien, révélé par la série "Teen Wolf".