Un jeune apprenti meunier reçoit les enseignements d'un maître de la magie noire extrêmement sévère, jusqu'au jour où il décide de se rebeller.
Pendant la guerre de Trente Ans, le jeune Krabat devient apprenti meunier aux côtés de onze autres jeunes garçons, auxquels le maître enseigne également la magie noire. Un jour, il rencontre Kantorka, une jeune paysanne dont il tombe amoureux. Mais le maître ne doit surtout pas l'apprendre...