Guillaume enquête sur la mort d'un second moine, retrouvé dans une cuve remplie de sang de cochon. L'inquisiteur Bernardo Gui se rapproche de l'abbaye.
L'Europe en 1327, sur fond de conflit théologique et politique entre l'Eglise et les Franciscains. Les troupes de l'empereur Louis IV et celles du pape Jean XXII se livrent une guerre féroce en Italie. A l'issue d'une bataille sanglante, le jeune Adso, 17 ans, en désaccord avec son père, le général de Melk, choisit de s'enfuir de chez lui. Il part avec Guillaume de Baskerville, un franciscain, ancien inquisiteur. Ensemble, ils se rendent dans un monastère isolé du Nord de l'Italie. A leur arrivée, ils apprennent que la veille, un moine, frère Adelme, a fait une chute mortelle. Fin détective, Guillaume de Baskerville comprend que le malheureux a été assassiné. L'abbé lui demande d'enquêter...