Un moine franciscain et son novice enquêtent sur une série de meurtres commis dans une abbaye. Ils sont eux-mêmes l'objet d'une enquête de l'Inquisition.
Dans l'abbaye, un moine disparaît mystérieusement. William cherche une nouvelle paire de lunettes pour inspecter les livres de la bibliothèque, Adso tombe amoureux d'une paysanne à l'esprit libre. La chasseuse Anna part en mission pour venger sa famille...