Après avoir découvert l'Atlantide et sauvé le peuple de la Cité perdue, Milo et son expédition doivent éviter à la Terre d'être victime de forces surnaturelles.
D'étranges événements mettent en péril la surface de la Terre. Milo et son équipe d'explorateurs, qui viennent à peine de sauver l'Atlantide et sa population, doivent faire face à d'autres dangers qui menacent la planète. Avec l'aide de Kida, ils affrontent un monstre des mers et d'inquiétants esprits...