Travaillant dans une auberge anglaise, un garçon découvre une carte indiquant l'emplacement du trésor du fameux capitaine Flint. Il part à sa recherche.
En Angleterre, dans l'auberge où il travaille, le jeune Jim voit passer un pirate peu aimable. Mais l'homme laisse derrière lui une étrange carte. Pour Jim, il s'agit d'une incroyable découverte. Car le vieux papier indique où se trouve le trésor du célèbre capitaine Flint. Pas d'hésitation : Jim et son amie la souris décident de mettre le cap sur l'île de l'océan Atlantique indiquée sur la carte. Mais, en route, ils croisent de drôles de pirates qui tentent eux aussi de trouver le butin. Faits prisonniers par le sinistre capitaine Silver, Jim et la souris font la connaissance de Cathy, qui n'est autre que la fille du capitaine Flint...
Un film d'animation sympathique tiré d'un roman de Stevenson.