"Décollage immédiat". Fatigués par leurs voisins lémuriens, les pingouins décident de partir en vacances sur la Lune.
Skipper, Kowalski, Rico et Private, quatre pingouins constitués en redoutable commando de choc, protègent le zoo de Central Park. Ils ont fort à faire, le lémurien King Julian, le aya-aye Maurice et le microcèbe Morti compromettant souvent la sécurité du zoo.