Second volet de l'enquête sur les facteurs qui ont conduit à l'attaque du 11-Septembre, avec une reconstitution de la traque d'Al-Qaida entre 1993 et 2001.
Cette seconde partie est consacrée à la course contre la montre commencée en 1993, au lendemain de la première attaque contre les tours jumelles. Elle revient aussi sur le grand mystère du 11-Septembre : plus d'un an avant les attaques, la CIA surveillait deux des futurs pirates de l'air. Les deux hommes, qui s'apprêtaient alors à se rendre aux Etats-Unis, tentaient de ne pas être repérés par le FBI. Le film reconstitue, pièce par pièce, le puzzle de la traque d'Al-Qaida, mettant en perspective les rendez-vous manqués qui, à la manière d'un engrenage infernal, ont inexorablement conduit au matin du 11 septembre-2001 et aux sanglants attentats perpétrés sur le sol américain.