Shredder, un individu démoniaque doué en arts martiaux, fait régner la terreur sur la ville. Seule une bande de quatre joyeuses tortues a le courage de l'affronter.
Donnie a transformé l'ancien wagon de Leatherhead en super véhicule blindé, le Shellraiser, qui fonctionne grâce à l'énergie de la pile à combustible des Krangs. Les tortues surprennent les Dragons Pourpres en train de dévaliser un magasin. Mais un super héros déguisé en tortue ninja s'interpose : le Pulvériseur...