Toujours en fuite, Loïs et Clark vont-ils réussir à mettre en échec le sinistre professeur Jefferson Cole, qui projette de détruire Metropolis ?
Après que son jugement a été prononcé, Loïs est totalement démoralisée. Elle se retrouve accusée d'un meurtre qu'elle n'a pourtant pas commis et croupit dans une cellule. Alors qu'elle pense être abandonnée de tous, Superman se manifeste. Pour la première fois, le super-héros prend le risque de s'opposer à la justice de son pays. Il parvient sans trop de peine à faire évader la jeune journaliste. Ensemble, ils prennent la fuite et se mettent immédiatement à la recherche du véritable assassin. Il leur faut faire vite. Le temps presse : tous deux savent que ce criminel est prêt à sacrifier des millions de vies humaines, sans aucun état d'âme...