De retour sur l'île, Daniel tente de prévenir le docteur Chang des dangers qu'il encourt. Pendant ce temps, Kate et Sawyer sont démasqués et doivent s'enfuir.
En 1977, revenu sur l'île en sous-marin, Daniel se sent investi d'une mission. En compagnie de Miles, il retrouve Jack et Kate et leur demande comment ils se sont retrouvés à cette époque. Un peu plus tard, il croise le docteur Chang et l'avertit des énormes risques qu'ils encourent à continuer les travaux de forage sur le futur site de l'Orchidée. Pendant ce temps, Kate et Sawyer sont démasqués et ne peuvent plus rester au sein du projet Dharma. Tous se réunissent pour décider ce qu'ils doivent faire : quitter l'île avec le sous-marin ou rejoindre les Autres, qui sont toujours réfugiés dans la jungle...