MacGyver part dans les Balkans, en compagnie de son ancien professeur d'archéologie et d'une charmante collègue, à la recherche du trésor de l'Atlantide.
MacGyver est contacté par son ancien professeur d'archéologie qui lui demande de l'aider à trouver le trésor de l'Atlantide. Le duo se rend dans les Balkans et met la main sur la clé permettant d'accéder au trésor. De retour en Angleterre, ils s'aperçoivent que d'autres convoitent le trésor...