Ben tient compte des appels reçus par Cal pour aider le capitaine Daly, qui tente de prouver son innocence. De son côté, Michaela épaule Autumn.
Ben vient en aide au commandant Daly, le pilote de l'avion, devenu le bouc émissaire de l'affaire du vol 828. Pour prouver qu'il n'a commis aucune faute, il réeffectue chaque jour le trajet du vol en simulateur. Mais les données météo officielles fournies n'ont rien à voir avec la violence de l'orage qu'il a traversé cette nuit-là. Daly est persuadé que le gouvernement a dissimulé la vérité derrière un rapport erroné. Les recherches de Ben et Daly les conduisent à Roger Mencin, un météorologue présent à proximité du lieu de l'incident le soir de leur disparition. Ce dernier leur apprend qu'ils ont été pris dans un orage qui produit une "foudre noire", un concentré d'anti-matière...