Phil Coulson, agent du S.H.I.E.L.D., réunit une petite équipe d'agents spéciaux pour lutter contre un mystérieux groupe appelé les Rising Tide.
Après la bataille de New York, le monde a changé. L'existence de super-héros, bons ou mauvais, a été révélée au monde entier. Pour protéger la population, qui n'est pas prête à affronter cette vérité, et alors que tout le monde le croyait mort, Phil Coulson, un agent du S.H.I.E.L.D, réunit une petite équipe d'agents spéciaux pour lutter contre un mystérieux groupe appelé les Rising Tide. L'équipe part à la recherche d'un homme qui a gagné des pouvoirs inhabituels et potentiellement dangereux...