Deux fillettes qui s'installent à la campagne avec leur père découvrent qu'elles habitent à proximité d'un arbre abritant une étrange créature.
Pour se rapprocher de leur mère hospitalisée, deux petites filles, Satsuki et Mei, s'installent dans une vieille maison de campagne avec leur père. Elles explorent les environs et finissent par faire la rencontre de Totoro, une créature débonnaire qui leur fait découvrir les mystères cachés de la nature...