La quatrième grande guerre ninja est déclarée. L'Akatsuki n'hésite pas à ressusciter d'anciens ennemis avec l'aide de Kabuto. L'alliance ninja doit faire face au danger...
Shikamaru, Chôji, Neji et Kiba se retrouvent face à face avec des visages tout droit sortis du passé. Les ninjas du Quartet d'Oto sont de retour grâce à la technique de l'Edo Tensei et ils sont bien décidés à réclamer une revanche...