La quatrième grande guerre ninja est déclarée. L'Akatsuki n'hésite pas à ressusciter d'anciens ennemis avec l'aide de Kabuto. L'alliance ninja doit faire face au danger...
Le garçon qui contrôle la météo se révèle être Yôta, un garçon qui était arrivé au village de Konoha plusieurs années avant, devenant l'ami secret des enfants du village, dont Naruto...