Après une longue absence au cours de laquelle il a suivi un entraînement spécifique, Naruto, apprenti ninja, revient à Konoha sa ville natale.
Après une absence de trois ans au cours de laquelle il a suivi un entraînement spécifique avec Jiraya, Naruto est de retour à Konoha, sa ville natale. Il retrouve tous ses camarades de l'Académie des ninjas, ainsi que ses professeurs. Tout le monde semble avoir changé, sauf Kakashi, toujours égal à lui-même. Grâce à tout ce qu'il a appris, Naruto va tout mettre en oeuvre pour protéger son village de la menace extérieure.