Les agents du NCIS tentent de retrouver une adolescente, kidnappée à son école, et dont les deux parents militaires sont actuellement en service en mer.
Un établissement scolaire est évacué à la suite d'une fuite de gaz. A la fin de l'alerte, Rebecca Mason, 13 ans, manque à l'appel. Rebecca vit chez son grand-père, Nicolas Mason, car ses parents, tous les deux militaires, sont déployés avec leur unité en mer. Nicolas Mason pense que les ravisseurs vont demander une rançon : la mère de Rebecca vient, en effet, de toucher un héritage. L'affaire se complique lorsque les agents du NCIS comprennent que Nicolas, qui a été contacté par les ravisseurs, a prévu de les rencontrer seul. Il semble qu'un groupe d'intervention spécial, qui ne rend compte qu'au Président en personne, soit à l'origine du rapt...