Vance est informé par le Pentagone que la radio du sous-marin à bord duquel Gibbs et Bishop sont montés pour les besoins de leur enquête a cessé d'émettre.
C'est le dernier jour de Ducky au NCIS. Un plongeur en mission à bord du sous-marin USS Memphis meurt au cours d'un exercice de plongée. Bishop et Gibbs enquêtent à bord quand le sous-marin plonge soudain en immersion et passe en silence radio. Les deux agents découvrent que le capitaine a reçu l'ordre du Pentagone de faire feu sur la flotte russe. Gibbs a des doutes sur la validité de ces ordres mais doit bien commencer par se fier aux gradés du bâtiment. Et si la mort du plongeur et cette manoeuvre de guerre étaient liées ? Avec l'aide de Bishop, il tente de résoudre cette énigme qui risque de provoquer une Troisième Guerre mondiale...