Les agents enquêtent sur le meurtre d'un major, qui avait été déclaré mort lors des attentats du 11 septembre au Pentagone : des restes humains ont été découverts sur un chantier.
Des restes humains sont découverts sur un chantier immobilier à New York. L'équipe du NCIS découvre qu'il s'agit du corps du major de la marine, Ellen Wallace, qui avait été tué 18 ans auparavant dans l'attaque du 11 septembre 2001 contre le Pentagone. Fille d'une légende de l'Armée, Ellen Wallace était surtout l'ex fiancée de Gibbs. Cette découverte va raviver de vieilles blessures...