En enquêtant sur le meurtre d'un homme, Goren et Eames découvrent qu'il était en lien avec des trafiquants d'armes. Leur supérieur tente d'étouffer l'affaire.
Au large des côtes somaliennes, un yacht transportant des touristes ouvre le feu sur un navire, tuant un cheik et son épouse. Pendant ce temps, à Manhattan, Loftin et Van Dekker célèbrent la réussite de leur plan. Avec la mort du cheik, ils vont pouvoir développer leur trafic d'armes. Pour avoir les coudées franches, ils font une proposition généreuse au capitaine Ross, afin qu'il ferme les yeux sur leurs affaires. Mais Broidy, un de leurs complices, est assassiné et son cadavre retrouvé à Pelham Park. En enquêtant sur ce meurtre, Goren et Eames découvrent que Broidy était un trafiquant d'armes. Ils en parlent à Ross, qui leur conseille d'abandonner l'affaire...
Cette neuvième saison débute par les départs de Vincent D'Onofrio, Kathryn Erbe et Eric Bogosian.