En raison des clauses particulières d'un nouveau programme-pilote établi par ses supérieurs, Nikita se voit dans l'obligation de quitter la Section One.
Embarrassés, Opérations et Madeline présentent à Nikita un nouveau programme-pilote, mis au point par Oversight. D'après ces nouvelles dispositions, la jeune femme devra quitter définitivement la Section One. Elle n'aura donc plus aucun contact avec son passé, ni avec ses anciennes connaissances. Ces bouleversements, pour le moins inattendus, éveillent des soupçons chez Nikita, qui se demande si on ne cherche pas tout simplement à l'évincer. Peu après, George, qui est lui-même menacé d'être écarté à son tour, lui rend visite et lui suggère de retourner à Section One pour éliminer Opérations. Nikita se résigne à cette douteuse mission, mais, une fois de retour, fait une fracassante découverte...