Wojira, le serpent de l'apocalypse, émerge des profondeurs avec Kalmaar et menace Ninjago. Les ninjas doivent agir rapidement pour sauver la ville.
Les ninjas Lloyd, Jay, Cole, Nya et Ka se lancent dans une mission périlleuse pour retrouver leur ami Zale. Envoyé par Aspheera dans le royaume de Non-retour, Zale est maintenant prisonnier de l'Empereur de Glace. Dans leur quête, de nombreux obstacles attendent ces héros, ils doivent notamment affronter l'armée des soldats de glace et le général Vex. Le Chapitre de Glace, qui fait suite au Chapitre de Feu et conclue Les Secrects du spinjitzu interdit, ravira les petits comme les plus grands.