La machine est affectée par un virus qui enraye son fonctionnement. Reese et Finch sont sur la trace d'un homme qui a fait fortune dans la technologie.
Le compte à rebours continue de tourner, rapprochant du point zéro du virus : le moment où il aura raison de la machine. Finch parvient pourtant à obtenir un nouveau nom : celui d'Ernest Thornhill, le PDG d'une société de saisie de données, un homme que personne n'a jamais vu. Finch et Reese en arrivent rapidement à la conclusion que Thornhill n'existe pas et qu'il n'est autre que la machine, ou un système de défense qu'elle s'est créé. Root parvient à convaincre Finch de l'aider à libérer la machine à l'insu de Reese...