Arrivé à Bourg-en-vol, Sacha cherche d'urgence un centre Pokémon, afin de faire soigner Pikachu, qui est très malade...
Lors de leur visite à la falaise Muraille, Sacha pêche un Venalgue, qui attaque Pikachu avec son poison. Sur leur route, ils rencontrent Eddy et Luce, deux archéologues sous-marins. Ils recherchent Le Cousteau, un luxueux paquebot qui a sombré il y a bien des années. Sacha et Serena leur viennent en aide dans leur mission...